MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Gardel

Total Repeats: 44082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006831	AATG	2	8	59	66	50 %	25 %	25 %	0 %	58616728
2	NC_006831	CTC	2	6	113	118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616728
3	NC_006831	GATT	2	8	154	161	25 %	50 %	25 %	0 %	58616728
4	NC_006831	TAG	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616728
5	NC_006831	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616728
6	NC_006831	CTC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616728
7	NC_006831	CAT	2	6	375	380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616728
8	NC_006831	AGT	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616728
9	NC_006831	TAC	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616728
10	NC_006831	ACTA	2	8	601	608	50 %	25 %	0 %	25 %	58616728
11	NC_006831	CA	3	6	708	713	50 %	0 %	0 %	50 %	58616728
12	NC_006831	TCT	2	6	722	727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616728
13	NC_006831	TTAG	2	8	758	765	25 %	50 %	25 %	0 %	58616728
14	NC_006831	TAT	2	6	768	773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616728
15	NC_006831	GTT	2	6	776	781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616728
16	NC_006831	TCT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616728
17	NC_006831	T	6	6	859	864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006831	ATTT	2	8	937	944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006831	ATA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616729
20	NC_006831	GTA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616729
21	NC_006831	TAT	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
22	NC_006831	CAA	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616729
23	NC_006831	A	6	6	1097	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	58616729
24	NC_006831	TTA	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
25	NC_006831	TTG	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616729
26	NC_006831	ATA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616729
27	NC_006831	TCT	2	6	1198	1203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616729
28	NC_006831	GCT	2	6	1206	1211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616729
29	NC_006831	CAT	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616729
30	NC_006831	T	6	6	1251	1256	0 %	100 %	0 %	0 %	58616729
31	NC_006831	AGG	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616729
32	NC_006831	TATT	2	8	1297	1304	25 %	75 %	0 %	0 %	58616729
33	NC_006831	T	6	6	1325	1330	0 %	100 %	0 %	0 %	58616729
34	NC_006831	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
35	NC_006831	T	6	6	1349	1354	0 %	100 %	0 %	0 %	58616729
36	NC_006831	ATC	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616729
37	NC_006831	ATT	3	9	1403	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
38	NC_006831	TTA	2	6	1421	1426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
39	NC_006831	TAA	3	9	1468	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616729
40	NC_006831	TAAA	2	8	1507	1514	75 %	25 %	0 %	0 %	58616729
41	NC_006831	AAAAT	2	10	1519	1528	80 %	20 %	0 %	0 %	58616729
42	NC_006831	T	6	6	1547	1552	0 %	100 %	0 %	0 %	58616730
43	NC_006831	AT	3	6	1605	1610	50 %	50 %	0 %	0 %	58616730
44	NC_006831	AT	3	6	1638	1643	50 %	50 %	0 %	0 %	58616730
45	NC_006831	T	7	7	1699	1705	0 %	100 %	0 %	0 %	58616730
46	NC_006831	AAT	2	6	1727	1732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616730
47	NC_006831	TAG	3	9	1756	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616730
48	NC_006831	GCATA	2	10	1775	1784	40 %	20 %	20 %	20 %	58616730
49	NC_006831	TTTA	2	8	1807	1814	25 %	75 %	0 %	0 %	58616730
50	NC_006831	AAT	2	6	1868	1873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616730
51	NC_006831	TTG	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616730
52	NC_006831	ATT	2	6	1936	1941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616730
53	NC_006831	GTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616730
54	NC_006831	ACAG	2	8	1976	1983	50 %	0 %	25 %	25 %	58616730
55	NC_006831	TAT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616730
56	NC_006831	ATT	2	6	2050	2055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006831	TG	3	6	2095	2100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006831	T	6	6	2123	2128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006831	ATT	2	6	2135	2140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006831	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006831	A	7	7	2165	2171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006831	TAA	2	6	2185	2190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006831	TA	3	6	2209	2214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006831	ACAA	2	8	2247	2254	75 %	0 %	0 %	25 %	58616731
65	NC_006831	CAA	2	6	2272	2277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616731
66	NC_006831	TCT	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616731
67	NC_006831	AT	3	6	2429	2434	50 %	50 %	0 %	0 %	58616731
68	NC_006831	TTA	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616731
69	NC_006831	ATA	2	6	2602	2607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616731
70	NC_006831	GTA	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616731
71	NC_006831	A	6	6	2625	2630	100 %	0 %	0 %	0 %	58616731
72	NC_006831	TAA	2	6	2677	2682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616731
73	NC_006831	TA	3	6	2710	2715	50 %	50 %	0 %	0 %	58616731
74	NC_006831	T	7	7	2810	2816	0 %	100 %	0 %	0 %	58616731
75	NC_006831	TTA	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616731
76	NC_006831	CCA	2	6	2867	2872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58616731
77	NC_006831	AGT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616731
78	NC_006831	CTA	2	6	3164	3169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616732
79	NC_006831	T	6	6	3237	3242	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
80	NC_006831	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
81	NC_006831	T	8	8	3257	3264	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
82	NC_006831	CTT	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616732
83	NC_006831	AGTA	2	8	3298	3305	50 %	25 %	25 %	0 %	58616732
84	NC_006831	TAT	2	6	3324	3329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
85	NC_006831	TA	3	6	3416	3421	50 %	50 %	0 %	0 %	58616732
86	NC_006831	ATT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
87	NC_006831	TAT	2	6	3507	3512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
88	NC_006831	TTA	2	6	3596	3601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
89	NC_006831	TTG	2	6	3611	3616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616732
90	NC_006831	T	6	6	3638	3643	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
91	NC_006831	GTAG	2	8	3711	3718	25 %	25 %	50 %	0 %	58616732
92	NC_006831	TCC	2	6	3732	3737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616732
93	NC_006831	CTTTAT	2	12	3755	3766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58616732
94	NC_006831	CTT	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616732
95	NC_006831	TGT	2	6	3839	3844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616732
96	NC_006831	ATT	2	6	3949	3954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
97	NC_006831	GCA	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616732
98	NC_006831	T	6	6	4045	4050	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
99	NC_006831	T	6	6	4055	4060	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
100	NC_006831	GGTA	2	8	4069	4076	25 %	25 %	50 %	0 %	58616732
101	NC_006831	T	7	7	4111	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
102	NC_006831	GCCTT	2	10	4118	4127	0 %	40 %	20 %	40 %	58616732
103	NC_006831	TAT	2	6	4171	4176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006831	GTT	2	6	4193	4198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006831	AT	3	6	4248	4253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006831	TAA	2	6	4291	4296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006831	GTAT	2	8	4298	4305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006831	TG	3	6	4327	4332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006831	TCT	2	6	4413	4418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006831	TAA	2	6	4428	4433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006831	TTAC	2	8	4459	4466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_006831	TTA	2	6	4482	4487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006831	A	6	6	4553	4558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006831	ATA	2	6	4590	4595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
115	NC_006831	T	7	7	4612	4618	0 %	100 %	0 %	0 %	58616733
116	NC_006831	A	8	8	4654	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	58616733
117	NC_006831	A	7	7	4672	4678	100 %	0 %	0 %	0 %	58616733
118	NC_006831	ATTA	2	8	4849	4856	50 %	50 %	0 %	0 %	58616733
119	NC_006831	AAT	2	6	4889	4894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
120	NC_006831	ATA	2	6	4904	4909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
121	NC_006831	AAT	2	6	4981	4986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
122	NC_006831	TCC	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616733
123	NC_006831	ATTT	2	8	5016	5023	25 %	75 %	0 %	0 %	58616733
124	NC_006831	TGA	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
125	NC_006831	TGG	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616733
126	NC_006831	TAG	2	6	5121	5126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
127	NC_006831	GAT	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
128	NC_006831	ATA	2	6	5184	5189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
129	NC_006831	AGA	2	6	5263	5268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616733
130	NC_006831	GGT	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616733
131	NC_006831	GTG	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616733
132	NC_006831	GAT	2	6	5378	5383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
133	NC_006831	TA	4	8	5389	5396	50 %	50 %	0 %	0 %	58616733
134	NC_006831	GATT	2	8	5428	5435	25 %	50 %	25 %	0 %	58616733
135	NC_006831	ATG	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616734
136	NC_006831	ACTAA	2	10	5561	5570	60 %	20 %	0 %	20 %	58616734
137	NC_006831	T	8	8	5586	5593	0 %	100 %	0 %	0 %	58616734
138	NC_006831	CTT	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616734
139	NC_006831	TAG	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616734
140	NC_006831	CTCA	2	8	5752	5759	25 %	25 %	0 %	50 %	58616734
141	NC_006831	TAG	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616734
142	NC_006831	TAT	3	9	5854	5862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616734
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281	NC_006831	ACA	2	6	11102	11107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616739
282	NC_006831	CATGAA	2	12	11124	11135	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58616739
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284	NC_006831	TGA	2	6	11153	11158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616739
285	NC_006831	AGA	2	6	11177	11182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616739
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287	NC_006831	GTG	2	6	11200	11205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616739
288	NC_006831	AGAA	2	8	11215	11222	75 %	0 %	25 %	0 %	58616739
289	NC_006831	AAC	2	6	11224	11229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616739
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299	NC_006831	AGT	2	6	11688	11693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_006831	AGT	2	6	11747	11752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_006831	T	7	7	11930	11936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_006831	AAT	2	6	11940	11945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_006831	AT	3	6	14589	14594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_006831	TTTA	2	8	14603	14610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_006831	TACT	2	8	14942	14949	25 %	50 %	0 %	25 %	58616741
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405	NC_006831	ACC	2	6	15108	15113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58616741
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408	NC_006831	TAA	2	6	15180	15185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616741
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410	NC_006831	GGA	2	6	15331	15336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616741
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